Одесский военный госпиталь практически ровесник Одессы. Про его существование впервые упоминается в рапорте Сената 18 апреля 1797 года генерал-лейтенантом от инфантерии, Новороссийского военного и гражданского губернатора Бердяева Николая Михайловича (полный сборник Законов Российской империи с 1649 года по 1797 год том 24, с.509 и др., паспорт 411 Одесского окружного военного госпиталя).
Более двухсотлетняя история отображает все этапы становления медицины, в том числе и военной. На этапах госпиталя трудилось много корифеев медицинской науки, основоположники целых медицинских школ и направлений. Достаточно сказать, что в конце семидесятых годов трижды был и трудился основоположник военно-полевой хирургии М. И. Пирогов, а в 1920 году с открытием в госпитале клиник медицинского института: терапии, гинекологии, хирургии, отоларингологии, в нем трудились профессора В, П. Филатов, Н.О. Куроверов, Я.К. Гиммельфарб и др..
В 1808 году Одесский госпиталь включают в списки военных госпиталей военного министерства и закрепляют за 8 корпусом.
Госпиталь помогал больным и раненым с театра боевых действий в период Крымской войны, гражданской войны. В годы Великой Отечественной медики госпиталя, пройдя с войсками боевой путь, возвращали в строй бойцов на Южном, Воронежском, 1-ом Украинском фронтах.
За достигнутые успехи в медицинском обслуживании и в связи с 30-летием Победы в ВОВ 30 апреля 1975 года госпиталь награжден Орденом Красной Звезды и Грамотой Верховного Совета СССР с вручением Красного Знамени.
С апреля 1994 года окружной военный госпиталь реформированный в 411 военный госпиталь оперативного командования.
В сентябре 1994 года на базе госпиталя открылась Южно-Украинское начальное обучающе-практическое объединение (или Центр новых медицинских технологий).
Первую операцию провел ректор Одесского медицинского университета академик Валерий Николаевич Запорожан - минимально травматично и эффективна-эндоскопично.
Ныне 411 ВГОК является многопрофильным, специализированной лечебным и профилактическим заведением Украинских Вооруженных Сил, а также клинической научной и учебной базой Военно-медицинского управления Южного оперативного командования, Одесского медицинского университета имени М.И. Пирогова и медицинских училищ города Одесса.
В госпитале функционирует 43 лечебно-диагностических отделения на 1100 мест, в т.ч. 3 диагностических центра :
- диагностический инфекционных заболеваний;
- анестезиологии и интенсивной терапии,
расположенных в 12 основных лечебных корпусах, где работают около 200 докторов, 400 медсестер.
Среди медицинского персонала 1 академик, 5 докторов наук, 7 кандидатов наук, 8 заслуженных врачей Украины, 66 врачей вышей категории.
Госпиталь оборудован современной диагностической аппаратурой последнего поколения всемирно-известных фирм:
- "Сименс";
- "Карл Цейсс ";
- "Дженерал-электрик"
- "Кобас Мира";
- "Олимпус",
- "Алкон",
- "Топкон",
- "Томей".
В госпитале широко применяются новые методы лечения:
- плазмофорез, плазмосорбция, криоплазмофорез;
- эндоскопические хирургические вмешательства (холицистоктомия, удаление опухолей, кист яичников);
- лазеротерапия сетчатки глаза;
- магнитотерапия, мануальная терапия, массаж;
- иглорефлексотерапия, гипербарическая и гипобарическая оксигенация.
В госпитале работают высококвалифицированные гинекологи, применяются современные методы лечения заболеваний, в том числе бесплодия, оперативное лечение опухолей и других заболеваний.
За год в госпитале в среднем проходят лечение 15 тысяч больных, проводится более 7 тысяч разных операций, из них 43% повышенной сложности.
14 октября 1999 года 411 ВГОК прошел аккредитацию Министерства охраны здоровья Украины получил аккредитационный сертификат высшей категории.
С 1 октября 2007 года 411 ВГОК прошел реформирование и получил статус Военно-медицинского клинического центра Южного региона(ВМКЦ ЮР).